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ZIEL Institute for Food and Health

               
                  
 
Vereinigung für allgemeine und angewandte Mikrobiologie

 





Der Lehrstuhl für Mikrobielle Ökologie steht unter der Leitung von Siegfried Scherer. (Department für Grundlagen der Biowissenschaften, Wissenschaftszentrum Weihenstephan). Der Lehrstuhl ist mit dem ZIEL -  Institute for Food & Health assoziiert.

Im Mittelpunkt der Grundlagenforschung stehen hauptsächlich funktionale Genomik und Evolution 
neuer überlappender Gene der Krankheitserreger E.coli  EHEC und Pseudomonas aeruginosa. 
Daneben werden die Themengebiete Taxonomie und Biodiversität sowie Evolutionsbiologie bearbeitet. 
 
Anwendungsorientierte Forschungsvorhaben in Kooperation mit der Industrie konzentrieren sich auf die mikrobielle Ökologie von Lebensmitteln, insbesondere auf die Analyse der Mikrobiota und Hygiene sowie die Sekretion und Funktion von proteolytischen Enzymen aus kältetoleranten Pseudomonaden.

Die FTIR basierte Hochdurchsatzidentifizierung von Mikroorganismen führte zur Entdeckung und formalen Beschreibung zahlreicher neuer Spezies und Gattungen. Im Rahmen dieser Arbeiten wurde eine etwa 13.000 Isolate umfassende Stammsammlung lebensmittelrelevanter Bakterien und Hefen aufgebaut. 

Ein dritter Aufgabenbereich des Lehrstuhls umfasst die mikrobielle Diagnostik durch FTIR-Spektroskopie und molekulare Methoden sowie die Beratung für die Lebensmittelindustrie zur Prävention und Aufklärung von mikrobiologisch verursachten Schadensfällen. 







     

abgeschlossene Promotionen  







  

 

 

Aktuelles

Paper
Activity of a Holin-Endolysin System in the Insecticidal Pathogenicity Island of Yersinia enterocolitica (2018)

Paper
Reprogramming Human Siderocalin to Neutralize Petrobactin, the Essential Iron Scavenger of Anthrax Bacillus (2018)

Paper
Insecticidal Toxicity of Yersinia frederiksenii Involves the Novel Enterotoxin YacT (2018)

Paper
Dysfunction, Disease, and the Limits of Selection (2018)

Paper
Dynamic Proteome Alteration and Functional Modulation of Human Saliva Induced by Dietary Chemosensory Stimuli (2018)

Paper
Genome sequence of the novel virulent bacteriophage PMBT14 with lytic avtivity against Pseudomonas fluorescens DSM 50090 (2018)

Paper
The Novel Anaerobiosis-Responsive Overlapping Antisense to the Annotated Gene ECs2385 of Escherichia coli O157:H7 Sakai (Mai 2018)

Paper
Thermal treatment of skim milk concentrates in a novel shear-heating device: Reduction of thermophilic spores and physical properties (Febr. 2018)

Paper
A novel short L-arginine responsive protein-coding gene (laoB) antiparallel overlapping to a CadC-like transcriptional regulator in Escherichia coli O157:H7 Sakai originated by overprinting (2018)

Paper
Comparison between Listeria sensu stricto and Listeria sensu lato strains identifies novel determinants involved in infection (2017)

Paper
Denkvoraussetzungen und weltanschauliche Überzeugungen in der Biologie (2017)

Paper
Differentiation of ncRNAs from small mRNAs in Escherichia coli O157:H7 EDL933 (EHEC) by combined RNAseq and RIBOseq-ryhB encodes the regulatory RNA Ryhb and a Peptide, RyhP. (2017)

Paper
Complete circular genome sequence and temperature independent adaptation to Anaerobiosis of Listeria weihenstephanensis DSM 24698 (2017)

Paper
Discovery of numerous novel small genes in the intergenic regions of the Escherichia coli O157:H7 Sakai Genome (2017)

Paper
Spoilage of Microfiltered and Pasteurized Extended Shelf Life Milk Is Mainly Induced by Psychrotolerant Spore-Forming Bacteria that often Originate from Recontamination (2017)

Paper
Transcriptional and translational regulation by RNA thermometers, riboswitches and the sRNA DsrA in Escherichia coli O157:H7 Sakai under combined cold and osmotic stress adaptation. (2016)

Paper
Comparative Bioinformatics and Experimental Analysis of the Intergenic Regulatory Regions of Bacillus cereus hbl and nhe Enterotoxin Operons and the Impact of CodY on Virulence Heterogeneity (Mai 2016)

Paper
Acidified nitrite inhibits proliferation of Listeria monocytogenes - Transcriptional analysis of a preservation method (März 2016)

Paper
Translatomics combined with transcriptomics and proteomics reveals novel functional, recently evolved orphan genes in Escherichia coli O157:H7 (EHEC)

Paper
Evidence for the recent origin of a bacterial protein-coding, overlapping orphan gene by evolutionary overprinting (Dez. 2015).

Paper
Massive horizontal gene transfer, strictly vertical inheritance and ancient duplications differentially shape the evolution of Bacillus cereus enterotoxin operons hbl, cytK and nhe (Nov. 2015)