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Zentralinstitut für Ernährungs- und Lebensmittelforschung (ZIEL)

Abteilung Mikrobiologie
Technische Universität München
Weihenstephaner Berg 3
D-85350 Freising


 Taxonomie und Evolution
Prof. Dr. Siegfried Scherer


Im  Mittelpunkt des Interesses steht die inter- und intraspezifische Biodiversität mikrobieller Konsortien, sowie die Beschreibung neuer Arten. Dabei werden vor allem lebensmittelbürtige Mikrobengesellschaften untersucht. Als Referenz für Artbeschreibungen sowie für die Erfassung der Mikrobiodiversität und der Populationsstruktur innerhalb von Spezies oder Speziesgruppen dient die abteilungseigene Mikroorganismensammlung, welche derzeit etwa 7000 Stämme umfasst.


Ein zweiter Schwerpunkt liegt auf der theoretischen Analyse von Evolutionsvorgängen. Insbesondere geht es um die Frage nach Reichweite und Grenzen experimentell fassbarer mikroevolutiver Faktoren. Wie schnell laufen sie ab? Welche Art biologischer Information kann dadurch entstehen? Können durch mikroevolutive Faktoren makroevolutive Transitionen befriedigend beschrieben werden oder muss für solche Übergänge nach anderen Prozessen gesucht werden?
 

Publikationen "Taxonomie und Evolution" (Auswahl)  

 Mayr R, Busse HJ, Worliczek HL, Ehling-Schulz M, Scherer S (2006) Ornithinibacillus gen. nov., with the species Ornithinibacillus bavariensis sp. nov. and Ornithinibacillus californiensis sp. nov..International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 56, 1383-1389.

 Ehling-Schulz M, Svensson B, Guinebretiere MH, Lindback T, Andersson M, Schulz A, Fricker M, Christiansson A, Granum PE, Martlbauer E Nyguyen-The C, Salkinoja-Salonen M and Scherer S (2005) Emetic toxin formation of Bacillus cereus is restricted to a single evolutionary lineage of closely related strains. Microbiology 151, 183-197.

 Loewe L, Textor V, Scherer S (2003) High deleterious genomic mutation rate in stationary phase of Escherichia coli. Science 302, 1558-1560.

 Scherer S, Junker R (2003) Evolution. In: Enzyklopädie Naturwissenschaft und Technik, 8. Ergänzungslieferung, Ecomed Verlagsgesellschaft, Landsberg/Lech, S. 1-10.

 Oberreuter H, Charzinski J, Scherer S  (2002) Intraspecific diversity of Brevibacterium linens, Corynebacterium glutamicum and Rhodococcus erythropolis based on partial 16S rDNA sequence analysis and Fourier-transform infrared (FT-IR) spectroscopy. Microbiology 148, 1523-1532.

 Oberreuter H, Seiler H, Scherer S (2002) Identification of coryneform bacteria and related taxa by Fourier-transformed infrared (FT-IR) spectroscopy. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 52: 91-100.

 Lechner S, Mayr R, Francis KP, Prüß B, Kaplan T, Wießner-Gunkel E, Stewart GSAB, Scherer S (1998) Bacillus weihenstephanensis sp.nov. is a new psychrotolerant species of the Bacillus cereus group. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 48, 1373-1382.

 Scherer S, Lechner S, Böger P (1993) psbD sequences of Bumilleriopsis filiformis (Heterokontophyta, Xanthophyceae) and Porphyridium purpureum (Rhodophyta, Bangiophycidae): evidence for polyphyletic origin of plastids. Current Genetics 24:437-442.

 Scherer S, Herrmann G, Hirschberg J, Böger P (1991) Evidence for multiple xenogenous origins of plastids: Comparison of psbA genes with a xanthophyte sequence. Current Genetics 19:503-507.

 Scherer S (1990) The protein molecular clock: Time for a re-evaluation. Evolutionary Biology 24, 83-106.

 Scherer S (1989) The relative rate test of molecular evolution: A note of caution. Molecular Biology and Evolution 6, 436-441.

 Scherer S (1985) Could life have arisen in the primitive atmosphere? Journal of Molecular Evolution 22, 91-94.

 Scherer S (1983) Basic functional states in the evolution of cyclic photosynthetic electron transport. Journal of Theoretical Biology 104, 289-299.

 Scherer S, Hilsberg T (1982) Hybridisierungen und Verwandtschaftsgrade innerhalb der Anatidae: Eine evolutionstheoretische und systematische Betrachtung. Journal für Ornithologie 123, 357-380.


Aktuelles

Stellenausschreibung Doktorandenstelle
Doktorand/in in molekularer Mikrobiologie zum Thema Funktion und Evolution überlappender Gene in Bakterien

Preisverleihung
Innovationspreis für Siegfried Scherer

Forschungspreis
Otto-von-Guericke Forschungspreis für Siegfried Scherer

Paper
Denkvoraussetzungen und weltanschauliche Überzeugungen in der Biologie (2017)

Paper
Differentiation of ncRNAs from small mRNAs in Escherichia coli O157:H7 EDL933 (EHEC) by combined RNAseq and RIBOseq-ryhB encodes the regulatory RNA Ryhb and a Peptide, RyhP. (2017)

Paper
Complete circular genome sequence and temperature independent adaptation to Anaerobiosis of Listeria weihenstephanensis DSM 24698 (2017)

Paper
Discovery of numerous novel small genes in the intergenic regions of the Escherichia coli O157:H7 Sakai Genome (2017)

Paper
High binding affinity of repressor IolR avoids costs of untimely induction of myo-inositol utilization by Salmonella Typhimurium (2017)

Paper
Genetic characterization of the Galactitol utilization pathway of Salmonella enterica serovar Typhimurium. (2017)

Paper
Heat stability of indigenous milk plasmin and peptidases from Pseudomonas: a challenge in the production of ultra-high temperature milk products (2016)

Paper
Spoilage of Microfiltered and Pasteurized Extended Shelf Life Milk Is Mainly Induced by Psychrotolerant Spore-Forming Bacteria that often Originate from Recontamination (2017)

Paper
Bakterieller Stoffwechsel als Pathogenitätsfaktor (2016)

Paper
Transcriptional and translational regulation by RNA thermometers, riboswitches and the sRNA DsrA in Escherichia coli O157:H7 Sakai under combined cold and osmotic stress adaptation. (2016)

Paper
Hysteresis in myo-inositol utilization by Salmonella Typhimurium (2016)

Paper
Probiotic Enterococcus faecalis Symbioflor® down regulates virulence genes of EHEC in vitro and decrease pathogenicity in a Caenorhabditis elegans model (2017)

Paper
Draft Genome Sequence of Lysinibacillus xylanilyticus SR-86 (Nov. 2016)

Paper
Permanent colonization of creek sediments, creek water and limnic water plants by four Listeria species in low population densities (November 2016)

Paper
Draft Genome Sequence of the Xanthan Producer Xanthomonas campestris LMG 8031 (Oktober 2016)

Paper
Comparative Bioinformatics and Experimental Analysis of the Intergenic Regulatory Regions of Bacillus cereus hbl and nhe Enterotoxin Operons and the Impact of CodY on Virulence Heterogeneity (Mai 2016)

Paper
Regulation of fucose and 1,2-propanediol utilization by Salmonella enterica serovar Typhimurium (März 2016)

Paper
Acidified nitrite inhibits proliferation of Listeria monocytogenes - Transcriptional analysis of a preservation method (März 2016)

Berufung Expertenrat
Prof. Dr. Siegfried Scherer wurde in den Expertenrat für Lebensmittelsicherheit des Bayerischen Staatsministeriums für Umwelt und Verbraucherschutz berufen.

Paper
Translatomics combined with transcriptomics and proteomics reveals novel functional, recently evolved orphan genes in Escherichia coli O157:H7 (EHEC)

Paper
A sensitive and robust method for direct determination of lipolytic activity in natural milk environment (März 2016, online first)

Paper
Evidence for the recent origin of a bacterial protein-coding, overlapping orphan gene by evolutionary overprinting (Dez. 2015).

Paper
Massive horizontal gene transfer, strictly vertical inheritance and ancient duplications differentially shape the evolution of Bacillus cereus enterotoxin operons hbl, cytK and nhe (Nov. 2015)

Paper
Chemodiversity of cereulide, the emetic Toxin of Bacillus cereus (2015)