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FTIR spectra libraries
Strain collection

Zentralinstitut für Ernährungs- und Lebensmittelforschung (ZIEL)

Abteilung Mikrobiologie
Technische Universität München
Weihenstephaner Berg 3
D-85350 Freising

 Prof. Dr. Siegfried Scherer
 Leitung Lehrstuhl für Mikrobielle Ökologie
 Zentralinstitut für Ernährungs- und Lebensmittelforschung ZIEL
 Tel.:  +49 (8161)71-3516
 Fax:  +49 (8161)71-4512
 e-mail: siegfried.scherer<at>

Curriculum vitae

Publications: Current fields of research
Microbial ecology
        Ecology of food borne microorganisms
        Taxonomy and evolution 

Former fields of research 
        Photosynthesis, respiration and nitrogen fixation of cyanobacteria
        Biochemistry of respiratory electron transport of cyanobacteria
        Proton translocation across the cytoplasmic membrane
        Molecular biology of bacteriophage

Curriculum vitae
1955                    Geboren in Oberndorf am Neckar
1974Studium der Biologie, Chemie und Physik an der Universität Konstanz.
1977Staatsexamen in Chemie und Physik
1980Diplom und Staatsexamen in Biologie
1983Promotion zum Dr.rer.nat. in Biologie, Universität Konstanz
1983-1988Arbeitsgruppenleiter am Lehrstuhl für Physiologie und Biochemie der Pflanzen an der Universität Konstanz
1986Forschungsaufenthalt am Institute of Microbiology, Chinese Academy of Science, China
1988-1989Forschungsstipendiat des DAAD am Department of Biochemistry, VirginiaTech, Blacksburg, USA
1989-1991Habilitationstipendiat der DFG an der Universität Konstanz
1990Ruf an die TU München
1991Habilitation an der Fakultät für Biologie, Universität Konstanz in den Fächern Pflanzenphysiologie und Mikrobielle Ökologie
1991Extraordinariat an der Technischen Universität München, Ernennung zum Direktor des Instituts für Mikrobiologie am FML Weihenstephan
1997Ernennung zum Geschäftsführer des FML Weihenstephan
2001 - 2004Mitglied der erweiterten Hochschulleitung der Technischen Universität München
2002Ruf auf ein Ordinariat an der Veterinärmedizinischen Universität Wien
2003Ruf auf den Lehrstuhl für Mikrobielle Ökologie, Department für Grundlagen der Biowissenschaften, Wissenschaftszentrum Weihenstephan, TU München
2003 - 2014Geschäftsführender Direktor des Zentralinstituts für Ernährungs- und Lebensmittelforschung (ZIEL) der TU München
2005Gute Lehre Preis der Studienfakultät für Biowissenschaften

Verleihung des Otto von Guericke Forschungspreises (Schnelle Identifizierung von Mikroorganismen durch FTIR Spektroskopie) 
2007Gute Lehre Preis der Studienfakultät
für Biowissenschaften
2007 - 2013

Prodekan der Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan


Nominierung für den Gute Lehre Preis des Bayerischen Staatsministeriums für Wissenschaft, Forschung und Kunst durch die Studienfakultät Ernährungswissenschaften des WZW
2016Berufung in den Expertenrat für Lebensmittelsicherheit des Bayerischen Staatsministeriums für Umwelt und Verbraucherschutz
2016Verleihung des Innovationspreises durch den MIV (Hervorragende wissenschaftliche Leistungen bei gleichzeitiger Praxisnähe)
2016Verleihung des Otto von Guericke Forschungspreises durch die AiF (Entwicklung einer routinetauglichen Quantifizierungsmethode von Bacillus cereus und Studien zur Bildung des Toxins in Lebensmitteln)
2017Ehrenurkunde der TU München für Exzellenz in der Lehre



A novel pH-regulated, unusual 603 bp overlapping protein coding gene pop is encoded antisense to ompA in Escherichia coli O157:H7 (EHEC). (2020)

Pseudomonas haemolytica sp. nov., isolated from raw milk and skimmed milk concentrate (2020)

Pseudomonas saxonica sp.nov. isolated from raw milk and skimmed milk concentrate. (2020)

Thermally induced milk fouling: Survival of thermophilic spore Formers and potential of contamination (Dez 2019)

Optimality in the standard gentic code is robust with respect to comparison code sets (2019)

Accurate quantification of thermophilic spores in dairy powders (2019)

Pseudomonas lactis sp. nov. and Pseudomonas paralactis sp. nov., isolated from bovine raw milk (2017)

Resistance of thermophilic spore formers isolated from milk and whey products towards cleaning-in-place conditions: Influence of pH, temperature and milk residues (2019)

Proposal of Lysobacter pythonis sp. nov. isolated from royal pythons (Python regius) (2019)

The novel EHEC gene asa overlaps the TEGT transporter gene in antisense and is regulated by NaCl and growth Phase (Dec 2018)

The small RNA RssR regulates myo-inositol degradation by Salmonella enterica (Dec.2018)

Activity of a Holin-Endolysin System in the Insecticidal Pathogenicity Island of Yersinia enterocolitica (2018)

Reprogramming Human Siderocalin to Neutralize Petrobactin, the Essential Iron Scavenger of Anthrax Bacillus (2018)

Insecticidal Toxicity of Yersinia frederiksenii Involves the Novel Enterotoxin YacT (2018)

Dysfunction, Disease, and the Limits of Selection (2018)

Dynamic Proteome Alteration and Functional Modulation of Human Saliva Induced by Dietary Chemosensory Stimuli (2018)

Genome sequence of the novel virulent bacteriophage PMBT14 with lytic avtivity against Pseudomonas fluorescens DSM 50090 (2018)

The Novel Anaerobiosis-Responsive Overlapping Antisense to the Annotated Gene ECs2385 of Escherichia coli O157:H7 Sakai (Mai 2018)

Thermal treatment of skim milk concentrates in a novel shear-heating device: Reduction of thermophilic spores and physical properties (Febr. 2018)

A novel short L-arginine responsive protein-coding gene (laoB) antiparallel overlapping to a CadC-like transcriptional regulator in Escherichia coli O157:H7 Sakai originated by overprinting (2018)

Thermal resistance of vegetative thermophilic spore forming bacilli in skim milk isolated from dairy Environments (2017)

Comparison between Listeria sensu stricto and Listeria sensu lato strains identifies novel determinants involved in infection (2017)


Differentiation of ncRNAs from small mRNAs in Escherichia coli O157:H7 EDL933 (EHEC) by combined RNAseq and RIBOseq-ryhB encodes the regulatory RNA RyhB and a Peptide, RyhP. (2017)

Complete circular genome sequence and temperature independent adaptation to Anaerobiosis of Listeria weihenstephanensis DSM 24698 (2017)

Discovery of numerous novel small genes in the intergenic regions of the Escherichia coli O157:H7 Sakai Genome (2017)

Spoilage of Microfiltered and Pasteurized Extended Shelf Life Milk Is Mainly Induced by Psychrotolerant Spore-Forming Bacteria that often Originate from Recontamination (2017)

Transcriptional and translational regulation by RNA thermometers, riboswitches and the sRNA DsrA in Escherichia coli O157:H7 Sakai under combined cold and osmotic stress adaptation. (2016)

Comparative Bioinformatics and Experimental Analysis of the Intergenic Regulatory Regions of Bacillus cereus hbl and nhe Enterotoxin Operons and the Impact of CodY on Virulence Heterogeneity (Mai 2016)

Acidified nitrite inhibits proliferation of Listeria monocytogenes - Transcriptional analysis of a preservation method (März 2016)

Translatomics combined with transcriptomics and proteomics reveals novel functional, recently evolved orphan genes in Escherichia coli O157:H7 (EHEC)

Evidence for the recent origin of a bacterial protein-coding, overlapping orphan gene by evolutionary overprinting (Dez. 2015)

Massive horizontal gene transfer, strictly vertical inheritance and ancient duplications differentially shape the evolution of Bacillus cereus enterotoxin operons hbl, cytK and nhe (Nov. 2015)